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同时，集装箱的标准化还给集装箱的载运工具和装卸机械提供了选型、设计和制造的依据，从而使集装箱运输成为相互衔接配套、化和率的运输系统。集装箱标准按使用范围分，有国际标准、国家标准、地区标准和公司标准四种。是指根据国际标准化组织（ISO）第104技术制订的国际标准来建造和使用的国际通用的标准集装箱。
集装箱标准化历经了一个发展过程。国际标准化组织ISO/TC104技术自1961年成立以来，对集装箱国际标准作过多次补充、增减和修改，现行的国际标准为第1系列共13种，其宽度均一样（2438mm）、长度有四种（12192mm、9125mm、6058mm、2991mm）、高度有三种（2896mm、2591mm、2438mm）。此类集装箱标准，是由地区组织根据该地区的特殊情况制订的，此类集装箱仅适用于该地区。如根据欧洲国际铁路联盟（VIC）所制订的集装箱标准而建造的集装箱。某些大型集装箱船公司，根据本公司的具体情况和条件而制订的集装箱船公司标准，这类箱主要在该公司运输范围内使用。
此外，世界还有不少非标准集装箱。如非标准长度集装箱有美国海陆公司的35ft集装箱、轮船公司的45ft及48ft集装箱；非标准高度集装箱，主要有9ft和9.5ft两种高度集装箱；非标准宽度集装箱8.2ft宽度集装箱等。由于经济效益的驱动，世界上20ft集装箱总重达24ft的越来越多，而且普遍受到欢迎。随着中国经济的不断腾飞，我国进出口贸易也越来越频繁，从而使集装箱的使用在市场上也得到更广泛的应用，集装箱内部的大长、宽、高尺寸。高度为箱底板面至箱顶板下面的距离，宽度为两内侧衬板之间的距离，长度为箱门内侧板量至端壁内衬板之间的距离。它决定集装箱内容积和箱内货物的大尺寸。
散货集装箱是用以装载粉末、颗粒状货物等各种散装的货物的集装箱。液体货集装箱是用以装载液体货物的集装箱。冷藏集装箱是一种附有冷冻机设备，并在内壁敷设热传导率较低的材料，用以装载冷冻、保温、保鲜货物的集装箱。汽车集装箱是一种设计用来装运汽车，并可分为两层装货的集装箱。牲畜集装箱（PENCONTAINER）是一种设计用来装运活"牲畜的集装箱，有通风设施，带有喂料和除粪装置。
兽皮集装箱是一种设计用来装运生皮等带汁渗漏性质的货物，有双层底，可存贮渗漏出来的液体的集装箱。按制造材料分制造材料是指集装箱主体部件（侧壁、端壁、箱顶等）材料，可分成三种：有钢制装箱、铝合金集装箱、玻璃钢集装箱，此外还有木集装箱、不锈钢集装箱等。其中：钢制集装箱，用钢材造成，优点是强度大，结构牢，焊接性高，水密性好，价格低廉；玻璃钢集装箱，用玻璃钢材料造成，优点是强度大，刚性好，内容积大，隔热、防腐、耐化学性好，易清扫，修理简便。
集装箱装卸区：是集装箱运输中，箱或货装卸交换保管的具体经办部门。它受承运人或其代理人的委托，进行下列各项业务：对整箱货运的交换、保管；设有集装箱货运站者，办理拼箱货的交接；安排集装箱船的靠泊，装卸集装箱，每航次编制配载图；办理有关货运单证的编签；编制并签验集装箱运用运载工具的出入及流转的有关单证；办理集装箱及运载工具、装卸工具的情况检查、维修，以及空箱的清扫、熏蒸等工作；空箱的收发、存贮和保管；安排空箱和重箱在堆场的堆码，及编制场地分配计划；其他有关业务工作。集装箱装卸区一般由码头、、堆场、货运站、指挥塔、修理部门、大门和办公室组成。有时堆场或货运站等可延伸到市区内部事5-15公里的中转站。
